Casos
Tomografias reais e anonimizadas com a anatomia segmentada. Clique em um caso para abrir no visualizador 3D, ou use Treinar para receber um caso sem o diagnóstico e procurar os achados você mesmo.
Fontes: TotalSegmentator dataset (Wasserthal et al., Radiology: AI 2023, CC BY 4.0), COVID-19 CT Lung and Infection Segmentation Dataset (Ma et al., Zenodo, CC BY 4.0) e Medical Segmentation Decathlon (Antonelli et al., Nature Communications 2022, CC BY-SA 4.0). Descrições dos achados elaboradas para fins educacionais — não substituem laudo radiológico.
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Fontes, licenças e limites
Todos os exames do atlas vêm de conjuntos de dados públicos e anonimizados, publicados por seus autores para pesquisa e ensino, sob licenças que permitem usar, adaptar e redistribuir o material citando a autoria. Esta página diz de onde veio cada caso e quem fez cada contorno.
Conjuntos de dados
TotalSegmentator dataset v2.0.1
Wasserthal J. et al., Radiology: Artificial Intelligence, 2023. Zenodo 10.5281/zenodo.10047292.
TCs de corpo inteiro e de regiões, com segmentação de referência. Casos de aorta, abdome, tórax e pelve.
CC BY 4.0COVID-19 CT Lung and Infection Segmentation
Ma J. et al., Zenodo 10.5281/zenodo.3757476.
TCs de tórax com a área acometida contornada por especialistas; aqui ela é separada por densidade em vidro fosco e consolidação, dentro dos lobos pulmonares.
CC BY 4.0Medical Segmentation Decathlon
Simpson A. L. et al., arXiv 2019; Antonelli M. et al., Nature Communications, 2022.
Casos oncológicos: o tumor (e a árvore vascular hepática) tem contorno de especialista; a anatomia ao redor foi segmentada localmente.
CC BY-SA 4.0Z-Anatomy e BodyParts3D
Z-Anatomy, Kervyn G., Zielinski M., Vinent L. (github.com/Z-Anatomy), a partir do BodyParts3D © The Database Center for Life Science (DBCLS), CC BY-SA 2.1 JP. Nomes em português da tradução do Z-Anatomy (Bigio A. T.).
Modelo 3D do corpo inteiro da página Anatomia 3D, com malhas simplificadas para a web. A orelha interna e o rim do Z-Anatomy têm licença não comercial e ficaram de fora. No modelo feminino, os ossos da pelve vêm do TotalSegmentator dataset (caso s0059, CC BY 4.0), os órgãos pélvicos e urinários, as mamas e os vasos do abdome e da pelve do Human Reference Atlas e o membro inferior da Visible Human Female (abaixo); a vagina é um modelo simplificado feito para o atlas. O modelo adaptado é redistribuído sob a mesma licença.
CC BY-SA 4.0Human Reference Atlas (HuBMAP)
Human Reference Atlas, NIH Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP), humanatlas.io — órgãos de referência 3D do corpo feminino (Visible Human Female): mamas, útero, ovários, tubas uterinas, bexiga, ureteres e rins, com suas subdivisões, e os vasos do abdome e da pelve.
Usados no modelo feminino da página Anatomia 3D: alinhados ao corpo do atlas pela pelve óssea, pela coluna, pelo esterno e (os vasos) pelos vasos correspondentes, com malhas simplificadas para a web; a pele sobre as mamas é moldada a partir delas.
CC BY 4.0Visible Human Female — membro inferior
Andreassen T. E., Hume D. R., Hamilton L. D., Walker K. E., Higinbotham S. E., Shelburne K. B. Three-dimensional lower extremity musculoskeletal geometry of the Visible Human Female and Male. Scientific Data 10, 34 (2023), doi:10.1038/s41597-022-01905-2. Center for Orthopaedic Biomechanics, University of Denver, a partir do Visible Human Project (National Library of Medicine).
Ossos, cartilagens, ligamentos do joelho e músculos do quadril ao pé do modelo feminino da página Anatomia 3D, alinhados osso a osso ao corpo do atlas, com malhas simplificadas para a web.
CC BY 4.0Texturas HD ilustrativas
As quatro texturas de mucosa, músculo, parênquima e cartilagem da página Anatomia 3D foram geradas para este projeto com uma ferramenta de IA. São imagens originais de aparência ilustrativa, sem fotografias de pacientes ou imagens externas como fonte. Elas acrescentam variações de cor e rugosidade às superfícies já presentes no modelo, inclusive durante a Trip; não acrescentam estruturas anatômicas.
As texturas não têm validação histológica e não representam o aspecto de um órgão ou paciente específico. A opção Texturas HD permite ativá-las, desativá-las e ajustar sua intensidade. A origem dessas imagens é distinta da dos exames e das malhas: as licenças Creative Commons citadas para os conjuntos de dados não são atribuídas às texturas geradas por IA.
Programas usados nas segmentações
TotalSegmentator (Wasserthal J. et al., 2023; licença Apache 2.0, tarefas de uso livre) rodou localmente
para segmentar lobos e anatomia do tórax (total), os derrames pleural e pericárdico
(pleural_pericard_effusion) e as lesões hepáticas (liver_lesions). Os materiais metálicos foram
separados por regras de densidade escritas neste projeto.
O que você pode fazer com o material
- Todos os conjuntos permitem usar, adaptar e redistribuir desde que a autoria seja citada (o “BY” das licenças).
- Os casos do Decathlon são CC BY-SA: o que derivar deles (imagens, segmentações) é redistribuído sob a mesma licença.
- Ao reaproveitar uma imagem daqui, cite o conjunto de dados de origem indicado na tabela abaixo.